Insegnamento
PROTEOMICS AND BIOCHEMICAL METHODOLOGIES
MEP5070483, A.A. 2016/17

Principali informazioni sull'insegnamento
Corso di studio Corso di laurea magistrale in
PHARMACEUTICAL BIOTECHNOLOGIES - BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
ME2193, ordinamento 2015/16, A.A. 2016/17
1144633
Crediti formativi 6.0
Denominazione inglese PROTEOMICS AND BIOCHEMICAL METHODOLOGIES
Dipartimento di riferimento Dipartimento di Scienze del Farmaco (DSF)
Obbligo di frequenza
Lingua di erogazione INGLESE
Sede PADOVA

Docenti
Responsabile PATRIZIA POLVERINO DE LAURETO BIO/10

Dettaglio crediti formativi
Tipologia Ambito Disciplinare Settore Scientifico-Disciplinare Crediti
CARATTERIZZANTE Discipline biotecnologiche comuni BIO/10 6.0

Modalità di erogazione
Periodo di erogazione Secondo semestre
Anno di corso I Anno
Modalità di erogazione frontale

Organizzazione della didattica
Tipo ore Crediti Ore di
Corso
Ore Studio
Individuale
Turni
LABORATORIO 1.0 15 10.0 Nessun turno
LEZIONE 5.0 40 85.0 Nessun turno

Calendario
Inizio attività didattiche 27/02/2017
Fine attività didattiche 09/06/2017
Orario della didattica Visualizza calendario delle lezioni
Giorno Ora Aula Edificio

Orario non definito


Commissioni d'esame
Commissione Dal Al Membri
2 Commissione a.a. 2016/2017 01/12/2016 30/09/2017 POLVERINO DE LAURETO PATRIZIA (Presidente)
SPOLAORE BARBARA (Membro Effettivo)
DE FILIPPIS VINCENZO (Supplente)

Syllabus
Prerequisiti: Gli studenti devono conoscere la struttura del DNA, dell'RNA e delle proteine, il concetto di genoma e le basi fondamentali della biochimica
Conoscenze e abilita' da acquisire: Lo scopo di questo corso è di fornire la conoscenza di tecniche di purificazione e caratterizzazione chimico-fisica di proteine e peptidi. In particolare sono approfonditi metodi per delucidare la struttura e definire le proprietà funzionali di proteine. Il laboratorio pratico introduce tecniche comunemente usate in biochimica come elettroforesi, cromatografia liquida, spettrometria di massa e biospettroscopia. Una ampia parte del corso si propone di presentare agli studenti le metodologie usate in proteomica e in spettrometria di massa.
Modalita' di esame: Esame orale finale.
Criteri di valutazione: Per sostenere il colloquio d’esame lo studente deve superare le schede dell’attività pratica e portarle il giorno dell’esame.
Contenuti: Il corso tratta argomenti che riguardano sia la caratterizazione chimica di proteine, che lo studio di un proteoma. In particolare quindi sono presentate tecniche che vanno dall'analisi di fingerprinting di una proteina e la determinazione della sequenza mediante degradazione di Edman, alla separazione di miscele complesse di proteine mediante 2D-eletroforesi e cromatografia multi-dimensionale. Una grande parte del corso è dedicata alla spettrometria di massa di proteine. Vengono presentate le più moderne tecniche di spettrometria di massa e massa-massa, sia dal punto di vista degli aspetti teorici che da quello della interpretazione degli spettri di massa.
Un altro argomento affrontato è la bioinformatica in proteomica. Come specifiche applicazioni di spettrometria di massa si affronteranno le determinazioni delle modifiche post-traduzionali. Infine argomenti quali la Proteomica Quantitativa,
Proteomica Funzionale verranno anche trattati.

In dettaglio gli argomenti trattati sono:
Finger-printing di una proteina
Determinazione della sequenza mediante degradazione di Edman
Proteomica: introduzione e teoria
2D-eletroforesi e cromatografia multi-dimensionale
Spettrometria di massa di proteine: strumentazione
Spettrometria di massa di proteine: teoria ed applicazioni
Spettrometria di massa tandem
Bioinformatica in proteomica
Determinazione delle modifiche post-traduzionali
Proteomica Quantitativa
Proteomica Funzionale
Applicazioni cliniche di proteomica
Attivita' di apprendimento previste e metodologie di insegnamento: Il corso viene svolto con lezioni frontali in aula. Le lezioni sono presentate mediante slides and presentazioni in power point.
Il laboratorio pratico viene svolto in laboratori attrezzati ed ogni studente ha disposizione attrezzature personali, per svolgere personalmente la sua attività.
Eventuali indicazioni sui materiali di studio: The diapositive del corso sono fornite agli studenti
Testi di riferimento:
  • Ninfa A.J., Ballou D.P., Metodologie di Base per la Biochimica e la Biotecnologia. --: Ed. Zanichelli, --. Cerca nel catalogo
  • Wilson K., Walker J., Metodologia Biochimica. --: Ed. Cortina, --. Cerca nel catalogo
  • Veenstra T.D., Yates III J.R, Proteomics for Biological Discovery. --: Ed. Wiley, --. Cerca nel catalogo