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a Ciclo Unico
Scuola di Scienze
SCIENZE STATISTICHE
Insegnamento
ALGORITMI PER LA BIOINFORMATICA
SCP4063209, A.A. 2015/16

Informazioni valide per gli studenti immatricolati nell'A.A. 2015/16

Principali informazioni sull'insegnamento
Corso di studio Corso di laurea magistrale in
SCIENZE STATISTICHE
SS1736, ordinamento 2014/15, A.A. 2015/16
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Crediti formativi 6.0
Tipo di valutazione Voto
Denominazione inglese ALGORITHMS FOR BIOINFORMATICS
Sito della struttura didattica http://scienzestatistiche.scienze.unipd.it/2015/laurea_magistrale
Dipartimento di riferimento Dipartimento di Scienze Statistiche
Obbligo di frequenza No
Lingua di erogazione ITALIANO
Sede PADOVA
Corso singolo È possibile iscriversi all'insegnamento come corso singolo
Corso a libera scelta È possibile utilizzare l'insegnamento come corso a libera scelta

Docenti
Responsabile MATTEO COMIN ING-INF/05

Mutuante
Codice Insegnamento Responsabile Corso di studio
INN1027815 ALGORITMI PER LA BIOINFORMATICA MATTEO COMIN IN0521

Dettaglio crediti formativi
Tipologia Ambito Disciplinare Settore Scientifico-Disciplinare Crediti
AFFINE/INTEGRATIVA Attività formative affini o integrative ING-INF/05 6.0

Organizzazione dell'insegnamento
Periodo di erogazione Secondo semestre
Anno di corso I Anno
Modalità di erogazione frontale

Tipo ore Crediti Ore di
didattica
assistita
Ore Studio
Individuale
LEZIONE 6.0 48 102.0

Calendario
Inizio attività didattiche 01/03/2016
Fine attività didattiche 11/06/2016
Visualizza il calendario delle lezioni Lezioni 2019/20 Ord.2014

Commissioni d'esame
Commissione Dal Al Membri
9 A.A. 2018/2019 01/10/2018 15/03/2020 COMIN MATTEO (Presidente)
PIZZI CINZIA (Membro Effettivo)
DI CAMILLO BARBARA (Supplente)
FERRARI CARLO (Supplente)
VANDIN FABIO (Supplente)
8 A.A. 2017/2018 01/10/2017 15/03/2019 COMIN MATTEO (Presidente)
PIZZI CINZIA (Membro Effettivo)
DI CAMILLO BARBARA (Supplente)
FANTOZZI CARLO (Supplente)
VANDIN FABIO (Supplente)
7 A.A. 2016/2017 01/10/2016 15/03/2018 COMIN MATTEO (Presidente)
PIZZI CINZIA (Membro Effettivo)
FERRARI CARLO (Supplente)
VANDIN FABIO (Supplente)
6 A.A. 2014/2015 01/10/2014 15/03/2016 COMIN MATTEO (Presidente)
PIZZI CINZIA (Membro Effettivo)
FANTOZZI CARLO (Supplente)
5 A.A. 2015/2016 01/10/2015 15/03/2017 COMIN MATTEO (Presidente)
PIZZI CINZIA (Membro Effettivo)
VANDIN FABIO (Supplente)

Syllabus
Prerequisiti:
Conoscenze e abilita' da acquisire: Imparare a tradurre un problema biologico in un problema matematico basato su grafi, alberi e stringhe; conoscere i principali algoritmi per l’analisi di sequenze biologiche; acquisire familiarita' con i metodi randomizzati che ricercano soluzioni approssimate per problemi intrattabili; imparare a presentare i risultati di un progetto e a lavorare in gruppo.
Modalita' di esame: Lo studente dovra' sostenere :
- un esame scritto
- un progetto che si compone di una tesina scritta e di una presentazione orale
Criteri di valutazione: Valutazione del grado di apprendimento degli argomenti trattati attraverso l'esame scritto.

Valutazione della capacita' di saper svolgere un'analisi critica della letteratura su uno specifico argomento (per i progetti di approfondimento bibliografico), capacita' di realizzare un software per una specifica analisi bioinformatica (per i progetti implementativi), capacita' di svolgere un'analisi critica dei risultati (per progetti sperimentali).

Capacita' di presentare i risultati del progetto in forma scritta e con presentazione orale.
Contenuti: Introduzione alla bioinformatica.

Algoritmi per la ricerca e scoperta di motivi funzionali e strutturali (segnali) in sequenze biologiche.

Tecniche di ricerca di segnali e caratterizzazione di sequenze sia basati sull'allineamento che alignment-free.

Algoritmi per la soluzione di problemi specifici in ambito di genome rearrangement, dna assembly, evoluzione delle specie, metagenomica.

Algoritmi e strutture dati per l'analisi combinatoriale in sequenze.
Attivita' di apprendimento previste e metodologie di insegnamento: Il corso viene erogato attraverso lezioni frontali. Inoltre vengono messi a disposizione degli studenti riferimenti bibliografici e lavori inerenti ai progetti che gli studenti dovranno sviluppare.
Eventuali indicazioni sui materiali di studio:
Testi di riferimento:
  • Jones, Neil C.; Pevzner, Pavel A., An Introduction to bioinformatics algorithms;. Cambridge (Mass.): London, MIT press, 2004. Cerca nel catalogo