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a Ciclo Unico
Scuola di Medicina e Chirurgia
PHARMACEUTICAL BIOTECHNOLOGIES - BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
Insegnamento
PROTEOMICS AND BIOCHEMICAL METHODOLOGIES
MEP5070483, A.A. 2019/20

Informazioni valide per gli studenti immatricolati nell'A.A. 2019/20

Principali informazioni sull'insegnamento
Corso di studio Corso di laurea magistrale in
PHARMACEUTICAL BIOTECHNOLOGIES - BIOTECNOLOGIE FARMACEUTICHE
ME2193, ordinamento 2015/16, A.A. 2019/20
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Crediti formativi 6.0
Tipo di valutazione Voto
Denominazione inglese PROTEOMICS AND BIOCHEMICAL METHODOLOGIES
Dipartimento di riferimento Dipartimento di Scienze del Farmaco (DSF)
Obbligo di frequenza
Lingua di erogazione INGLESE
Sede PADOVA
Corso singolo È possibile iscriversi all'insegnamento come corso singolo
Corso a libera scelta È possibile utilizzare l'insegnamento come corso a libera scelta

Docenti
Responsabile PATRIZIA POLVERINO DE LAURETO BIO/10

Dettaglio crediti formativi
Tipologia Ambito Disciplinare Settore Scientifico-Disciplinare Crediti
CARATTERIZZANTE Discipline biotecnologiche comuni BIO/10 6.0

Organizzazione dell'insegnamento
Periodo di erogazione Secondo semestre
Anno di corso I Anno
Modalità di erogazione frontale

Tipo ore Crediti Ore di
didattica
assistita
Ore Studio
Individuale
LABORATORIO 1.0 15 10.0
LEZIONE 5.0 40 85.0

Calendario
Inizio attività didattiche 02/03/2020
Fine attività didattiche 12/06/2020
Visualizza il calendario delle lezioni Lezioni 2019/20 Ord.2015

Syllabus
Prerequisiti: Gli studenti devono conoscere la struttura del DNA, del RNA e delle proteine, il concetto di genoma e le basi fondamentali della biochimica
Conoscenze e abilita' da acquisire: Lo scopo di questo corso è di fornire la conoscenza di tecniche di purificazione e caratterizzazione chimico di proteine e peptidi mediante un approccio proteomico. In particolare sono approfonditi metodi per identificare proteine in matrici complesse mediante spettrometria di massa. Il laboratorio pratico introduce tecniche comunemente usate in proteomica come elettroforesi bi-dimensionale, cromatografia liquida, spettrometria di massa. Una ampia parte del corso si propone di presentare agli studenti le metodologie usate in proteomica, come proteomica quantitativa e funzionale.
Modalita' di esame: Esame orale con discussione dei risultati ottenuti durante le esercitazioni e presentazione di un articolo concordato con il docente (28 points).
Valutazione della realazione di laboratorio (2 points)
Criteri di valutazione: L’esame ha lo scopo di verificare la conoscenza dello studente di aspetti e problematiche legate alla analisi di un proteoma. Inoltre verrà verificata la conoscenza delle moderne tecniche di spettrometria di massa.
Partecipazione e impegno in classe, valutato in base alle presenze.
Livello del pensiero critico dello studente, giudicato in base ai risultati delle valutazioni
tra pari.
Contenuti: Il corso tratta argomenti che riguardano sia la caratterizazione chimica di proteine, che lo studio di un proteoma. In particolare quindi sono presentate tecniche che vanno dall'analisi di fingerprinting di una proteina e la determinazione della sequenza mediante degradazione di Edman, alla separazione di miscele complesse di proteine mediante 2D-eletroforesi e cromatografia multi-dimensionale. Una grande parte del corso è dedicata alla spettrometria di massa di proteine. Vengono presentate le più moderne tecniche di spettrometria di massa e massa-massa, sia dal punto di vista degli aspetti teorici che da quello della interpretazione degli spettri di massa.
Un altro argomento affrontato è la bioinformatica in proteomica. Come specifiche applicazioni di spettrometria di massa si affronteranno le determinazioni delle modifiche post-traduzionali. Infine argomenti quali la Proteomica Quantitativa,
Proteomica Funzionale verranno anche trattati.

In dettaglio gli argomenti trattati sono:
Finger-printing di una proteina
Determinazione della sequenza mediante degradazione di Edman
Proteomica: introduzione e teoria
2D-eletroforesi e cromatografia multi-dimensionale
Spettrometria di massa di proteine: strumentazione
Spettrometria di massa di proteine: teoria ed applicazioni
Spettrometria di massa tandem
Bioinformatica in proteomica
Determinazione delle modifiche post-traduzionali
Proteomica Quantitativa
Proteomica Funzionale
Applicazioni cliniche di proteomica
Attivita' di apprendimento previste e metodologie di insegnamento: Il corso viene svolto con lezioni frontali in aula. Le lezioni sono presentate mediante slides and presentazioni in power point.
Se disponibili, sono mostrati brevi filmati.
Il laboratorio pratico viene svolto in laboratori attrezzati ed ogni studente ha disposizione attrezzature personali, per svolgere la sua attività.
Eventuali indicazioni sui materiali di studio: Le diapositive del corso e i materiali di studio vengono forniti agli studenti
Testi di riferimento:
  • Ninfa A.J., Ballou D.P., Metodologie di Base per la Biochimica e la Biotecnologia. --: Ed. Zanichelli, --. Cerca nel catalogo
  • Wilson K., Walker J., Metodologia Biochimica. --: Ed. Cortina, --. Cerca nel catalogo
  • Veenstra T.D., Yates III J.R, Proteomics for Biological Discovery. --: Ed. Wiley, --. Cerca nel catalogo

Didattica innovativa: Strategie di insegnamento e apprendimento previste
  • Lecturing
  • Laboratory
  • Problem based learning
  • Case study
  • Interactive lecturing
  • Working in group
  • Questioning
  • Problem solving
  • Mappe concettuali

Didattica innovativa: Software o applicazioni utilizzati
  • Moodle (files, quiz, workshop, ...)

Obiettivi Agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
Istruzione di qualita' Uguaglianza di genere