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a Ciclo Unico
Scuola di Agraria e Medicina Veterinaria
BIOTECHNOLOGIES FOR FOOD SCIENCE
Insegnamento
GENOMICS
AVQ2100522, A.A. 2023/24

Informazioni valide per gli studenti immatricolati nell'A.A. 2023/24

Principali informazioni sull'insegnamento
Corso di studio Corso di laurea magistrale in
BIOTECHNOLOGIES FOR FOOD SCIENCE
AV2644, ordinamento 2022/23, A.A. 2023/24
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Curriculum BIOTECHNOLOGIES FOR FOOD SCIENCE [002LE]
Crediti formativi 11.0
Tipo di valutazione Voto
Denominazione inglese GENOMICS
Sito della struttura didattica http://www.agrariamedicinaveterinaria.unipd.it/
Dipartimento di riferimento Dipartimento di Biomedicina Comparata e Alimentazione (BCA)
Sito E-Learning https://samv.elearning.unipd.it/course/view.php?idnumber=2023-AV2644-002LE-2023-AVQ2100522-N0
Obbligo di frequenza
Lingua di erogazione INGLESE
Sede LEGNARO (PD)
Corso singolo È possibile iscriversi all'insegnamento come corso singolo
Corso a libera scelta È possibile utilizzare l'insegnamento come corso a libera scelta
Corso per studenti Erasmus Gli studenti Erasmus+ o di altri programmi di mobilità possono frequentare l'insegnamento

Docenti
Responsabile LUCA BARGELLONI BIO/13
Altri docenti SARA FAGGION AGR/17
SILVIA FARINATI AGR/07
ALESSANDRO VANNOZZI AGR/07

Dettaglio crediti formativi
Tipologia Ambito Disciplinare Settore Scientifico-Disciplinare Crediti
CARATTERIZZANTE Discipline biotecnologiche comuni BIO/13 5.0
CARATTERIZZANTE Discipline veterinarie e riproduzione animale AGR/17 2.0
CARATTERIZZANTE Medicina di laboratorio e diagnostica AGR/07 4.0

Organizzazione dell'insegnamento
Periodo di erogazione Secondo semestre
Anno di corso I Anno
Modalità di erogazione in presenza

Tipo ore Crediti Ore di
didattica
erogata
Ore Studio
Individuale
Turni
ESERCITAZIONE 1.0 8 17.0 Nessun turno
LABORATORIO 1.0 8 17.0 2
LEZIONE 9.0 72 153.0 Nessun turno

Calendario
Inizio attività didattiche 26/02/2024
Fine attività didattiche 15/06/2024
Visualizza il calendario delle lezioni Lezioni 2023/24 Ord.2022

Commissioni d'esame
Commissione Dal Al Membri
2 Commissione a.a. 2023/24 01/12/2023 30/11/2024 BARGELLONI LUCA (Presidente)
VANNOZZI ALESSANDRO (Membro Effettivo)
FAGGION SARA (Supplente)
FARINATI SILVIA (Supplente)
1 Commissione a.a. 2022/23 01/12/2022 30/11/2023 BARGELLONI LUCA (Presidente)
VANNOZZI ALESSANDRO (Membro Effettivo)
FAGGION SARA (Supplente)

Syllabus
Prerequisiti: Fundamentals of genetics and molecular biology
Conoscenze e abilita' da acquisire: Learn how to plan a genome sequencing project (preparatory phase, sequencing approach choice, functional annotation)
How to organize and understand high-throughput analysis of gene expression
How to identify and use genome-wide sequence variation for selective breeding and gene-trait association analysis
Modalita' di esame: Test on Moodle on course contents and written assignments
Criteri di valutazione: Online test and evaluation of assignments will cover both practical and theoretical learning objectives. The student is expected to know how to use genomic tools for genome/transcriptome sequencing, annotation, and for genetic selection
Assessment criteria include the degree of knowledge of acquired information and the capability of implementing the most appropriate tools for a specific problem.
Contenuti: The course lectures cover:
• The structure of eukaryotic genomes (genome size and architecture, gene organization, comparative genomics)
• Sequencing platforms (Sanger sequencing, Illumina massive parallel sequencing, Single-molecule long read sequencing)
• Transcriptomics (transcriptome assembly, gene expression quantification)
• Genome assembly and functional annotation (genome assembly software, ab initio gene prediction, evidence-based annotation, genome browser)
• Genome variability (single base variants, structural variation, high-throughput genotyping methods)
• Applied genetics (quantitative traits, phenotyping, selective breeding, genomic selection, GWAS, genomic prediction)
Attivita' di apprendimento previste e metodologie di insegnamento: Frontal lectures, groups activities, paper presentations, and lab practicals
Eventuali indicazioni sui materiali di studio: The material used for the course will be made available to students through the Moodle platform of the School at
https://elearning.unipd.it/scuolaamv/login/index.php


Genomics is a rapidly moving and dynamic field that has blossomed during the last years. Although a number of recent textbooks are available that cover some course topics, many of the genomic applications to plant and animal improvement continue to evolve. Thus, a collection of recently published articles in scientific journals will be the primary source of course content, which are available through the course website.
Testi di riferimento:
  • Maria S. Poptsova, Genome Analysis: Current Procedures and Applications.. --: Caister Academic Press, 2014. Cerca nel catalogo
  • B.D. Singh and A.K. Singh, Marker-Assisted Plant Breeding: Principles and Practices.. --: Springer, 2015. Cerca nel catalogo

Didattica innovativa: Strategie di insegnamento e apprendimento previste
  • Lavori di gruppo
  • Problem solving
  • Flipped classroom
  • Attivita' di valutazione durante il corso

Obiettivi Agenda 2030 per lo sviluppo sostenibile
Fame Zero La vita sott'acqua