BARCACCIA GIANNI

Recapiti
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Struttura Dipartimento Agronomia Animali Alimenti Risorse Naturali e Ambiente (DAFNAE)
Telefono 0498272814
Qualifica Professore ordinario
Settore scientifico AGR/07 - GENETICA AGRARIA
Rubrica di Ateneo  Visualizza
 

Avvisi e altre informazioni
Responsabile di BreedOmics – Servizi di analisi genomiche per il miglioramento genetico di specie agro-alimentari.


Tipologie dei servizi:

Estrazione e purificazione di DNA genomico totale ad alto peso molecolare
(isolamento di DNA genomico mediante mini-prep)

Isolamento di DNA genomico con sistema automatizzato
(isolamento di DNA genomico in piastre da 96 campioni)

Valutazione della qualità e della quantità di DNA genomico
(mediante analisi elettroforetica e spettrofotometrica o fluorimetrica)

Fingerprinting di DNA genomico mediante marcatori PCR-derivati di tipo STS
(analisi di marcatori SCAR in gel di agarosio con marcatura luminescente)

Fingerprinting di DNA genomico mediante marcatori PCR-RFLP
(analisi di marcatori CAPS in gel di agarosio con marcatura luminescente)

Fingerprinting di DNA genomico mediante marcatori AP-PCR e I-SSR
(analisi di marcatori multi-locus PCR-derivati con primer universali ed elettroforesi capillare)

Fingerprinting di DNA genomico mediante marcatori AFLP
(analisi di marcatori AFLP, S-SAP e M-AFLP con primer EcoRI/PstI e MseI/TaqI ed elettroforesi capillare)

Genotyping di DNA genomico mediante marcatori singolo-locus SSR
(analisi di genotipizzazione mediante SSR saggiati in multiplex attraverso elettroforesi capillare)

Barcoding di DNA mitocondriale e plastidiale mediante sequenziamento
(analisi di marcatori SNP di geni Cox1 e CytB e rbcL e trnH-psbA in matrici agro-alimentari)

Haplotyping di DNA mediante sequenziamento genico
(analisi di marcatori SNP di geni nucleari singola-copia per la definizione di aplotipi)

Elaborazione statistica dei dati sperimentali
(calcolo indici di diversità genetica e coefficienti di similarità genetica, gradi di omozigosi/eterozigosi,
determinazione di matrici di distanze genetiche, costruzione di alberi NJ e UPGMA, definizione di aplotipi e genotipi)


Caratterizzazione genetica di varietà (linee pure, cloni e ibridi F1)
(analisi dei parametri DUS e ACS in relazione al grado di omozigosi/eterozigosi e alla differenziazione
allelica tra genotipi utilizzando marcatori SSR mappati: 1 per braccio cromosomico del genoma X della specie)

Orario di ricevimento
Ufficio del docente c/o DAFNAE Si riceve tutti i giorni previo appuntamento concordato telefonicamente o mediante posta elettronica
(aggiornato il 15/07/2013 16:16)

Proposte di tesi
Argomenti per tesi sperimentali:

1) Analisi della struttura genetica di popolazioni di specie agro-alimentari;

2) Miglioramento genetico assistito da marcatori molecolari in specie agro-alimentari;

3) Sviluppo di saggi diagnostici per la rin-tracciabilità genetica di specie agrarie e dei loro derivati alimentari.

4) Clonaggio genico e studio dell'espressione genica in organi riproduttivi di specie modello.

Curriculum Vitae
Formazione accademica
Gianni Barcaccia si è laureato in Scienze Agrarie presso l’Università di Perugia nel 1991. Dal 1992 ha trascorso lunghi periodi presso laboratori italiani, europei e americani, interessandosi soprattutto di Genetica della produzione sementiera. Nel 1995 ha conseguito il Dottorato di Ricerca presso l’Istituto di Miglioramento Genetico dell’Università di Perugia, occupandosi di Genetica dei sistemi riproduttivi e di Genetica delle popolazioni. Nel 1998 ha vinto il concorso per Ricercatore bandito dall’Università di Padova. Dal 2004 al 2016 è stato Professore Associato di Genetica Agraria presso la Scuola di Agraria e Medicina Veterinaria dell’Università di Padova. Dal 2017 è Professore Ordinario per il settore concorsuale di Genetica Agraria.

Docenza
La docenza presso l’Università di Padova comprende tre insegnamenti: uno di Genetica agraria, svolto come compito istituzionale per titolarità nell’ambito del corso di laurea in Scienze e Tecnologie Agrarie, e due come affidamento di incarico, Genomica applicata e Miglioramento genetico, nell’ambito dei corsi di laurea in Biotechnologies for Food Science e Sustainable Agriculture, afferenti alla Scuola di Agraria e Medicina Veterinaria. L’attività include anche un corso di Tracciabilità genetica degli alimenti nell’ambito del Master di secondo livello in Qualità e Sicurezza dei Prodotti Alimentari.

Ricerca
Svolge ricerche in diverse aree: i) sistemi riproduttivi e, in particolare, analisi del controllo genetico-molecolare di apomissia e barriere riproduttive come maschio-sterilità e auto-incompatibilità; ii) analisi del genoma con marcatori SSR e SNP per il mappaggio genico e il miglioramento genetico (MAB); iii) analisi dei trascrittomi con tecnologie di RNA profiling e NG sequencing; iv) studio della biodiversità e caratterizzazione/identificazione genomica di varietà mediante DNA genotyping; v) sviluppo di saggi diagnostici per la tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari mediante DNA fingerprinting e DNA barcoding.

Compiti accademici
Dal 2004 è membro della Scuola di Dottorato in Crop Science. Dal 2015 al 2019 è stato Vice-Direttore di Dipartimento. Attualmente è Direttore del Dipartimento di Agronomy Food Natural resources Animals and Environment (DAFNAE) per il quadriennio accademico 2019-23.

Collaborazioni di ricerca
Da 20 anni vanta collaborazioni scientifiche con diversi gruppi di ricerca europei e americani, e partecipa come relatore a numerosi congressi nazionali e internazionali di genetica e genomica di specie agro-alimentari. E’ coinvolto in numerosi progetti di ricerca finanziati da Ministeri Italiani, Ateneo di Padova e Regione Veneto. Negli ultimi anni ha stipulato con regolarità contratti di ricerca con Aziende Sementiere Italiane. Svolge attività di revisore per riviste scientifiche internazionali di genetica, genomica e miglioramento genetico. E’ inoltre responsabile del Servizio di analisi genomiche per il miglioramento genetico nell’ambito del Laboratorio di Genomica di Dipartimento.

Pubblicazioni scientifiche
E’ autore di oltre 100 pubblicazioni che includono per lo più articoli su riviste internazionali indicizzate con revisori, oltre a numerosi riassunti in atti di congressi italiani e internazionali. Detiene migliaia di records di sequenze nucleotidiche nelle banche dati NCBI. Inoltre ha pubblicato un’opera di Genetica e Genomica, suddivisa in tre volumi Genetica generale, Miglioramento genetico e Biotecnologie genetiche.

Aree di ricerca
Principali Aree e Linee di Ricerca

i) Studio del sistema riproduttivo delle piante e, in particolare, analisi del controllo genetico-molecolare di apomissia, maschio-sterilità e auto-incompatibilità;
ii) Analisi del genoma mediante marcatori molecolari PCR-derivati per la costruzione di mappe genetiche, il mappaggio genico e il miglioramento genetico assistito (MAB);
iii) Analisi dei trascrittomi mediante tecnologie di mRNA profiling e piattaforme NG sequencing;
iv) Clonaggio genico e studio dell’espressione genica mediante Real-Time qPCR;
v) Studio della biodiversità e caratterizzazione genomica di popolazioni attraverso SSR genotyping e SNP haplotyping;
vi) Sviluppo di saggi diagnostici molecolari per la rin-tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari mediante DNA fingerprinting e DNA barcoding.

Parole-chiave: genetica delle popolazioni; controllo genetico dei sistemi riproduttivi delle piante; genomica strutturale e funzionale; miglioramento genetico assistita da marcatori molecolari; tracciabilità genetica di prodotti agro-alimentari.

Pubblicazioni
Pubblicazioni scientifiche

Autore di oltre 100 articoli scientifici pubblicati su riviste internazionali indicizzate (101 e 106 articoli sono disponibili nelle banche dati Web of Science e Scopus, 56 articoli sono disponibili anche nelle banche dati NCBI PubMed) dei quali il 70% come primo o ultimo autore oppure autore corrispondente (www.researchgate.net/profile/Gianni_Barcaccia/publications). Inoltre è autore di un’opera accademica di Genetica e Genomica, suddivisa in tre volumi: Genetica generale, Miglioramento genetico e Biotecnologie genetiche (www.liguori.it).

Alcune delle ultime pubblicazioni scientifiche sono incluse in un numero speciale di Frontiers of Plant Science (www.frontiersin.org/research-topics/8183/genetics-and-genomics-of-plant-reproduction-for-crop-breeding), come ad esempio le seguenti: Galla et al. (2019) Ovule gene expression analysis in sexual and aposporous apomictic Hypericum perforatum L. (Hypericaceae) accessions (doi: 10.3389/fpls.2019.00654), Alagna et al. (2019) The paradox of self-fertile varieties in the context of self-incompatible genotypes in olive (doi: 10.3389/fpls.2019.00725), Palumbo et al. (2019) Genomics of flower organ identity in grapevine (Vitis vinifera L.) (doi: org/10.3389/fpls.2019.00316), Palumbo et al. (2019) Construction of the first SNP-based linkage map using genotyping-by-sequencing and mapping of the male-sterility gene in leaf chicory. (doi.org/10.3389/fpls.2019.00276).

La pubblicazioni scientifiche sono acquisibili consultando il sito web personale (www.giannibarcaccia.com/publications/).

Insegnamenti dell'AA 2019/20
Corso di studio (?) Curr. Codice Insegnamento CFU Anno Periodo Lingua Responsabile
IF0362 002LE AVP5073497 8 I Anno (2019/20) Primo
semestre
ENG GIANNI BARCACCIA
AG0056 COMUNE AGL1000104 8 II Anno (2019/20) Primo
semestre
ITA GIANNI BARCACCIA
IF0362 001LE MVN1031739 10 I Anno (2019/20) Primo
semestre
ITA GIANNI BARCACCIA
AV2293 COMUNE AVP5073598 8 I Anno (2019/20) Secondo
semestre
ENG GIANNI BARCACCIA